fisher线性判别的步骤
制作测序报告需要注意什么?
制作测序报告需要注意什么?
制作测序报告要注意,1. 测序所用模板DNA的量一般按下表要求加入:由于超螺旋质粒产生的信号比松驰的线性双链DNA弱,因此使用超螺旋质粒作为模板时其用量要比其它模板大一些。
模板种类/长度t模板量
200 bp(PCR产物)t16 ng(120 fmol)
3000-5000 bp(超螺旋质粒DNA)t4 mg(2 pmol)
48 000 bp(λ粘粒DNA)t1 mg(31 fmol)
2. 计算与4.5 pmol 相当的引物纳克数可用以下一般公式:
4.5 pmol1.5 ng×n,其中n为引物碱基数
计算与1 pmol 相当的引物微克数可用以下一般公式:
dsDNA:1 pmol(6.6×10-4 mg)×n,其中n为模板碱基对数
ssDNA:1 pmol(3.3×10-4 mg)×n,其中n为模板碱基数
3. 为阻止TaqDNA聚合酶延伸非特异性退火引物,热循环仪必须预热至95℃。温度变换应越快越好。下面的循环时间不包括变温时间。如果你无法确定使用何种模式,建议从模式1开始。
模式1:适用于引物lt24碱基或GC含量lt50%
95℃2分钟。然后:95℃30秒(变性),42℃30秒(退火),70℃1分钟(延伸)。
模式2:适用于≥24碱基或略短的GC含量≥50%的引物。
95℃2分钟。然后:95℃30秒(变性),70℃30秒(退火/延伸)。
4. 在加入终止溶液之后样品可在4℃保存过夜。
5. 水的质量对于染色的成功极其重要。超纯水(NANOpureR或Milli-QR的水)或双蒸水可获得较好的效果,如果水中有杂质,则低分子量条带可能无法出现。
6. 碳酸钠也非常重要。使用新鲜的,美国化学学会级碳酸钠较好,如Fisher和KodakACS试剂级碳酸钠,一般可获得较好的结果。
如何在matlab上实现fisher线性判别?
求助,fisher判别法对多类进行判别的程序Fisher判别的基本思路就是投影,针对P维空间中的某点x(x1,x2,x3,…,xp)寻找一个能使它降为一维数值的线性函数y(x):y(x)∑Cjxj然后应用这个线性函数把P维空间中的已知类别总体以及求知类别归属的样本都变换为一维数据,再根据其间的亲疏程度把未知归属的样本点判定其归属。这个线性函数应该能够在把P维空间中的所有点转化为一维数值之后,既能最大限度地缩小同类中各个样本点之间的差异,又能最大限度地扩大不同类别中各个样本点之间...